如需在Prism中选择剂量反应模型,需回答以下四个问题:
Prism为剂量反应曲线提供两组方程。一组假设X作为剂量或浓度的对数。另一组则假设X作为剂量或浓度。务必选择一组与数据相匹配的方程。
Prism分别为刺激和抑制各提供一组剂量反应方程。抑制方程是为下坡运行而建立。唯一区别是抑制方程拟合IC50(“I”代表“抑制”),而刺激方程拟合EC50(“有E”代表“有效”)。
如果曲线上升,应在一组刺激方程中进行选择。如果曲线下降,应在一组抑制方程中进行选择。
Prism提供运用标准斜率的方程,该方程的Hill斜率为1.00(用于促刺激)或-1.00(用于抑制),以及可变斜率(通过Prism拟合)。名称中无“可变斜率”的方程默认为标准斜率。在无异质性或协同性的情况下,测量配体与受体的结合时,预期为标准斜率。但事实证明,许多其他log(剂量)与反应曲线具有相同的标准斜率。
如果数据存在不少可导致反应的浓度值,且其可在10%-90%之间反应,则可让Prism对斜率进行拟合。如果数据只提供一两个可在10%-90%之间具有反应的浓度值,则数据无法真正提供定义斜率的信息,可能需要选择一个具有固定斜率的模型。
选择并不简单,而在许多情况下并不清楚哪种方法更好。
如果数据已标准化,曲线因而从Y=0延伸到Y=100,您可能希望选择一个标准化模型。此类模型不对底部和顶部稳定段进行拟合,而是强制设定底部稳定段等于0,顶部稳定段等于100。仅当您极为精确地决定了可定义0与100的值后,才选择“规准反应”方程。仅仅因为数据已标准化并不意味着必须以该方式对曲线进行约束。
在许多情况下,并不清楚标准化模型的使用是否有意义。这并不总是一个简单的决定。
Prism具备两组用于特异性剂量反应情况的特殊模型。一组用于接受X输入为浓度值,一组用于接受X输入为log(浓度)值: