Please enable JavaScript to view this site.

剂量反应模型有四项参数:底部稳定段、顶部稳定段、EC50和斜率因子(通常限制在一个标准值)。

在许多情况下,拟合剂量反应曲线的主要目的是确定EC50的最佳拟合值,EC50是在顶部和底部稳定段之间激发反应的浓度。如果这些稳定段未很好定义,则EC50将非常不确定。考虑该方法:如果未非常精确定义“100”和“0”,也未精确定义“50”,因此不能精确确定EC50。如果数据未真正定义稳定段,也没有任何控制数据来评估顶部和底部稳定段,则无法精确确定EC50。

许多实验包括测量最大和最小可能反应的控件。有两种方法可将这些控件纳入您的分析:

将顶部和底部限制为由控件确定的值。然后只拟合EC50和斜率。

标准化数据,使反应从0到100,使用控件通过Prism规范化分析定义0和100。然后使用非线性回归拟合一个“标准化反应”模型。此类模型不对底部和顶部稳定段进行拟合,而是强制设定底部稳定段等于0,顶部稳定段等于100。

将所有数据包含在拟合中。对于无药物定义的质控品,输入一个非常低的浓度作为X,可能较实际使用的最小浓度低两个量级。对于另一种药物定义的非特异性对照品,输入一个值较大的浓度,可能较最大浓度高两个量级。现在所有数据均在一个表中,且X值合理。使用非线性回归拟合所有四项参数(底部、顶部、EC50和斜率)。空白数据和非特异性数据有助于定义曲线,但不要像上文所列前两种方法那样压倒计算。Weimer及其同事建议使用这种方法(1)。

注:

在拟合剂量反应数据前,无需标准化。许多情况下最好显示实际数据。

几个不同的剂量反应曲线具有可比性时,只能用一个轴在一张图上绘制。如果不同的实验测量了不同的变量,标准化会将其变为可比单位。这可能很有帮助。

无论是否选择标准化数据,您仍需要选择如何适应数据。是否想让Prism找到顶部和底部稳定段的最佳拟合值?还是您想让这些稳定段由控制数据来决定?这是一个重要的决定。

如果对数据进行标准化,可选择一个标准化剂量反应方程。限制曲线从0%到100%运行。只有由良好的控制数据定义0%和100%时,这种约束才有意义。如果0%和100%的定义是模糊的,则“50%”的定义也是模糊的,因此EC50也是模糊的。

仅仅因为选择标准化数据并不意味着您必须限制曲线从0到100%运行。Prism拟合这两个稳定段仍有意义,因此所有数据(不仅仅是用于标准化的控件)均用来适应稳定段。Weimer和他的同事表明这是一种分析数据的好方法。

如果未标准化数据,您可使用“约束”选项卡将“顶部”和“底部”固定为由控制实验确定的值。因此,约束顶部和底部的决定与在拟合之前对数据进行标准化的决定截然不同。

可将其中一项参数(顶部或底部)固定为常数值,但另一项参数不能固定。

如果标准化,也不要选择对数据进行不同的加权。一旦减去基线(非特异性)值,Y个重复值之间的方差不可能与Y成正比

 

参考文献

1.Weimer,M.、Jiang,X.、Ponta,O.、Stanzel,S.、Freyberger,A.和Kopp-Schneider,A.(2012),数据转换对浓度 - 反应建模的影响。《毒理学快报》213:292-298。

© 1995-2019 GraphPad Software, LLC. All rights reserved.