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X值为剂量或浓度的对数时,使用该方程。X值为浓度或剂量时,使用相关方程。

引言

变构调节剂可以减弱或增强激动剂结合。该模型拟合在没有和存在调节剂的情况下测定的整个剂量反应曲线。其目标是了解调节剂与其位点结合的亲和力,并确定α的值,α是一个三元复合物常数,用于量化调节剂的结合改变放射性配体对受体位点的亲和力的程度。

循序渐进

1.创建一张XY数据表。

2.将激动剂配体浓度的对数输入X。如果浓度为1nM,输入“-9”。

3.采用任何实用单位,将反应输入Y。将无调节剂的数据输入A列。将采用调节剂常数浓度收集的数据输入B列。如有数据,请对C列、D列、E列、……(各列具有不同的调节剂浓度)重复上述步骤。

4.将调节剂浓度输入列标题(单位为摩尔,因此1nM输入为“1e-9”)。请勿忘记输入“0”作为数据集A的列标题。这些列标题不仅仅是标签。您输入的值将成为分析的一部分。

5.在数据表中,点击“分析”,选择“非线性回归”,然后选择“方程窗格”:剂量反应-特异性,X为log(浓度)。然后选择 变构EC50偏移,X为log(浓度)。

您无需将任何参数限制为常数值

模型

EC50=10^LogEC50

KB=10^LogKB

alpha=10^Logalpha

Antag=(1+B/KB)/(1+alpha*B/KB)

LogEC=Log(EC50*Antag)

Y=Bottom+(Top-Bottom)/(1+10^((LogEC-X)*HillSlope))

logEC50 是在没有调节剂的情况下引起一半最大反应的激动剂浓度对数。

logKb 是与其变构位点结合的调节剂平衡解离常数(摩尔)的对数。该对数采用相同的摩尔单位,用于将调节剂浓度输入数据表的列标题。

log Alpha 是三元复合物常数 的对数。α=1.0时,调节剂不会改变结合。如果α小于1.0,则调节剂会减弱配体结合。如果α大于1.0,则调节剂会增强结合。在所示示例中,α等于0.01,因此调节剂显著降低了结合。

顶部 底部 均为以Y轴为单位的稳定段。

注释

该模型设计用于分析调节剂通过变构位点起作用时的数据。由于激动剂和调节剂通过不同的位点起作用,因此将调节剂称为竞争剂并不正确。

该模型是为拟合α的对数(而非α本身)而创建。这是因为α不对称:从0到1的所有值均意味着调节剂减弱结合,而从1到无穷大的所有值均意味着调节剂增强结合。在对数标度上,其值更加对称,因此在对数标度上计算的置信区间(如Prism所计算)更精确。Prism报告α和log(α)。

该模型假设变构调节剂过量,因此您添加的浓度非常接近其自由浓度。当变构调节剂的浓度有限时(如G蛋白改变与许多受体结合的激动剂时),该模型不起作用。没有明确的模型可以处理这种情况。您需要使用隐式方程(等号两边均为Y)来定义该模型,而Prism不能处理此类方程。

注意变构调节剂浓度增加时曲线从左到右前进的两个重要点。首先,注意最大反应不会改变。其次,注意调节剂饱与其结合位点时,调节剂对右移剂量反应曲线的影响达到最大。

参考文献                                                                         

A. Christopoulos和T. Kenakin,Pharmacol,版本54:323-374,2002

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