混合模型是一个通用方程,包括竞争性抑制、非竞争性抑制和非竞争性抑制等特例。该模型比其他模型多一个参数,而这个参数可以告诉您抑制机制。
创建 XY 数据表。在 X 列输入底物浓度,在 Y 列输入酶活性。每个数据集(Y 列)代表在不同浓度的抑制剂存在下收集的数据,从零浓度开始。在列标题中输入这些浓度。请务必输入浓度,而不是浓度的对数。
输入数据后,单击分析,选择非线性回归,选择酶动力学方程面板,并选择酶抑制 混合 模型。
VmaxApp=Vmax/(1+I/(Alpha*Ki))
KmApp=Km*(1+I/Ki)/(1+I/(Alpha*Ki))
Y=VmaxApp*X/(KmApp + X)
参数I是抑制剂的浓度,是您在每列标题中输入的数值。该值受限于等于数据集常数。
参数Alpha、Vmax、Km和Ki是共享的,因此 Prism 对整个数据集拟合一个最佳控制数据值。
Vmax是没有抑制剂时的最大酶速,单位与 Y 相同。
Km 是Michaelis-Menten 常数,单位与 X 相同。
Ki 是 抑制常数,用与 I 相同的单位表示,您将其输入列标题。
Alpha 决定机制。它的值决定了抑制剂的结合改变酶对底物亲和力的程度。其值总是大于零。
•当 Alpha=1 时,抑制剂对酶和酶底物的亲和力相等。这与非竞争性抑制相同。
•当 Alpha>1 时,抑制剂优先与游离酶结合。
•当 Alpha 非常大时,几乎完全与游离酶结合,混合模型接近竞争性抑制。
•当 Alpha<1 时,抑制剂优先与酶-底物复合物结合。
•当 Alpha 非常小(但大于零)时,抑制剂几乎完全与酶-底物复合物结合,混合模型接近于非竞争模型。
科普兰建议避免使用混合模型一词,因为这很容易让人混淆,以为是指两种或两种以上药物的混合抑制作用。相反,他将本页中的模型称为非竞争性模型。按照这种思路,α = 1.0 的情况只是非竞争性抑制的一种特殊情况。
公式 3.2RA Copeland,《药物发现中酶抑制剂的评估》,第二版,Wiley 2013。书号:978-1-118-48813-3。