在高浓度下,一些底物也会抑制酶的活性。约为所有已知酶的20%时,会发生底物抑制。两个底物分子可与酶结合,阻断活性时,就会发生这种情况。
创建一张XY数据表。在X列中输入底物浓度,在Y列中输入酶活性。如果有多个实验条件,请将第一个放入A列,第二个放入B列,依此类推。
输入数据后,点击“分析”,选择“非线性回归”,选择“酶动力学方程”窗格,然后选择底物抑制。
Y=Vmax*X/(Km+X *(1+X/Ki))
Vmax是最大酶反应速度, 如果底物没有抑制酶的活性,采用与Y相同的单位表示
Km 是米氏常数,采用与X相同的单位。它描述了在无抑制剂的情况下,底物和酶的相互作用。
Ki 是 底物结合的解离常数,使得两种底物可与酶结合,采用与X相同的单位。
注:Prism 7和更高版本使用的初始值规则集(改进)不同于Prism 6。
如果重新排列,更容易理解拟合该模型的问题:
Y=Vmax/(Km/X+1+X/Ki)
Vmax控制峰值的高度(但不等于峰值处的Y值)。
X值很小时,最后一项接近零,因此曲线的前部分(小X值)由Km值决定。
相反,X值较大时,第一项接近零,因此曲线的后面部分(较高的X值)由Ki值决定。
曲线的中间部分由Ki和Km决定。
两个原因可解释为什么拟合会导致“模糊”的结果。
•在足够宽的X值范围内,不存在数据点。需要存在小于Km和大于Ki的X值,最好有大量的X值。如果仅曲线中间有数据,则没有信息来分别确定Km和Ki。
•曲线的形状虽然看起来像底物抑制曲线,但并不完全正确。换言之,数据不符合底物抑制模型。