在饱和结合实验中,改变放射性配体的浓度,并测量结合度。目的是确定Kd(平衡时结合一半受体位点的配体浓度)和Bmax(最大结合位点数)。
配体不仅结合受体位点,还结合非特异性位点。处理非特异性结合有三种方法。
•减去非特异性,然后仅分析特异性结合。
•仅分析总结合,根据总结合曲线的形状,推断非特异性结合的量。了解更多。
•同时全局分析总结合和非特异性结合。这是最好的方法,且详细解释如下。
创建一张XY数据表。将放射性配体浓度输入到X,将总结合输入到Y,且将非特异性结合输入到B列。
对X使用任何实用单位。将在这些相同的浓度单位中报告Kd。对总结合和非特异性结合使用相同单位。将以相同的单位报告Bmax。
另外,选择样本数据集: 结合-总结合和非特异性结合的饱和结合。
在数据表中,点击“分析”,选择“非线性回归”,选择“饱和结合方程”窗格,然后选择单位点--总结合和非特异性结合。
考虑将参数背景约束为常数值零。这是在不添加放射性配体结合时测量的“结合”,因此,其表示计数器背景(如有)。
特异性=Bmax*X/(X+Kd)
非特异性=NS*X+背景
<A>Y=特异性+非特异性
<B>Y=非特异性
<A>和<B>语法表示,第三行仅用于数据集A(总结合),而第四行仅用于数据集B(非特异性结合)。
参数NS和背景在两个数据集之间共享。
Bmax是最大特异性结合,采用与Y相同的单位。这是外推到极高浓度的放射性配体的特异性结合,因此,其值几乎始终高于实验测量的任何特异性结合。
Kd是平衡解离常数,采用与X相同的单位。这是处于平衡状态时,达到一半最大结合所需的放射性配体浓度。
NS是非特异性结合的斜率:以Y单位除以X单位为单位。
背景为在无添加放射性配体情况下的非特异性结合量。这表示计数器背景。如果您的计数器自动减去背景信号,则可将背景约束为常数值零。