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双向方差分析可以使用任意数量的数据集列，代表其中一个分组变量的不同水平，但通常只使用两个数据集。当有两列时，Prism 8 会报告两列均值之间的差异以及该差异的 95% 置信区间。

当行和列因素之间交互作用很小时，列均值之间的总体差值（及其置信区间）可能是一种有用的数据呈现方式。如果存在较强的交互作用，那么列均值之间的差值在各行之间各不相同，因此列均值之间的总体差值可能没有用处。

计算细节

•如果没有缺失值，则两列均值计算为该列中所有行的均值。如果有缺失值，则两列均值计算为该列所有行的预测均值的平均值。

•列平均值之间的差值计算为 B 列平均值减去 A 列平均值。

•计算差值的标准误差。使用下面的等式，其中 MSresidual 是方差分析表中报告的残差的均方差，Na 和 Nb 是两个样本量。如果 A 列有四行，输入数据一式三份，有一个缺失值，则 Na 等于 11。  

•误差幅度等于 SEdifference 乘以 t 分布的临界值，使用Na+Nb-2自由度。

•置信区间等于均值之差加上或减去误差幅度。