双因素方差分析（又称“双因子方差分析”）能够确定一个反应如何受到两项因素的影响。例如，您可测量男性和女性对三种不同药物的反应。在本示例中，药物治疗是一个因素，性别是另一个因素。如果每名受试者均仅评估一次（不同受试者服用不同药物），且男性和女性不以某种方式配对（配偶、兄弟姐妹），则您有普通（而非重复测量）双因素方差分析。