方差分析和重复测量方差分析

对于大多数多重比较检验，第一步是使用下方方程计算两个平均值之间差值的标准误差，其中n1和n2是被比较的两个平均值的样本量，而MSerror是方差分析表中适当的均方值。

对于未重复测量的单因素方差分析或双因素方差分析，方差分析表中只有一个MSerror（或MSresidual）。关于具有重复测量的双因素方差分析，见本文件中有关所用MS值的详细信息。

首先可通过以下方法计算以上方程中的合并标准偏差：

请注意，MSerror（和合并标准偏差）是根据所有组中的所有数据计算。如果样本量相等，则对于所有平均值对，平均值之间差值的SE相同。

重复测量方差分析之后的多重比较。

拟合混合效应模型之后的多重比较

通过重复测量数据，Prism允许您进行重复测量方差分析或拟合混合效应模型。没有缺失值时，两者等效。有缺失值时，不可能进行重复测量方差分析，但仍可拟合混合效应模型。

对于多重比较，差值的标准误差计算为sqrt（L*C*L'），其中 L 是对比的向量/矩阵 C 是最佳拟合值的方差 - 协方差矩阵。