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在 Prism 中使用两个以上的组进行Kaplan-Meier 生存分析时,可以选择包含多重比较来评估成对的组。该功能从 Prism 10.5 开始提供,生存分析对话框的多重比较选项卡上提供了该功能的选项。

通过这些控件,您可以精确指定 Prism 要执行的成对比较。您可以选择
•无多重比较检验 - 不进行比较
•将每条生存曲线与其他每条曲线进行比较 - 这将对生存分析中每种可能的组别组合执行比较检验。如果是三组(A、B 和 C),则有三种可能的比较(A vs B、A vs C 和 B vs C)。如果是四组,则有六种组合;如果是五组,则有十种组合,以此类推。
•将每列的生存曲线与对照组列的曲线进行比较--这是将单一对照组与其他每组进行单独比较。比较次数等于组数减一(5 组比较 4 次,3 组比较 2 次,以此类推)。
•比较预选的成对生存曲线--该选项允许您指定要进行的单个比较。在应用多重比较校正时,将只进行这些比较,也只考虑这些比较。请诚实地告诉自己到底要进行多少次比较。在看到数据后才选择特异性比较,很可能会导致修正方法应用不当。下文将对此进行更详细的讨论
您必须诚实地说出您正在进行的比较的数量。假设有四个治疗组(包括对照组 A)。然后,您再将存活时间最长的一组与存活时间最短的一组进行比较。说您只做了一个比较是不公平的,因为您在没有查看所有数据的情况下无法决定做哪一个比较。如果有四个组,您可以进行六次成对比较:
1.A vs B
2.A vs C
3.A vs D
4.B vs C
5.B vs D
6.C vs D
通过观察数据并选择最短和最长的曲线,您已经隐含地进行了所有这些比较,因此您必 须相应地对结果进行适当的修正。
另一方面,如果您在进行实验之前就知道,您只想将三个处理组中的每个处理组与对照组进行比较,而对处理组之间的比较不感兴趣,那么您就会进行三次比较:
1.A 与 B
2.A 与 C
3.A vs D
Prism 提供了三种不同的方法来处理多重比较检验的修正:
1.使用统计检验对多重比较进行校正
2.通过控制错误发现率 (FDR) 来纠正多重比较
3.不校正多重比较。每个比较单独进行
Prism 的默认设置是使用统计假设检验。
这种方法首先执行所有指定的比较,并确定它们各自的 P 值。然后,它使用进行比较的次数以及指定的修正方法,并调整各个 P 值,以确保族内错误率(α)保持在指定值。这种修正方法的净结果是,调整后的 P 值大于未修正的 P 值,以保持指定的 alpha 值。Prism 提供了三种修正方法,用于调整生存分析后统计检验假设的多重比较:
1.Holm-Šídák- 该检验是 Prism 在生存分析后校正多重比较的默认方法。它的检验力通常高于其他选项
3.希达克
错误发现率法采用了与统计检验假设方法不同的方法。虚假发现率法不是提高阈值来宣布结果 "统计学显著"(通过降低 alpha 值或等效地提高单个 P 值),而是控制假阳性率。另一种说法是,这种方法可以确保在被认定为 "发现 "的结果中,只有小于特定百分比的结果是假发现。这个百分比称为错误发现率(用 Q 表示),在进行分析时指定。
Prism 提供了三种方法控制错误发现率。这三种方法都能决定哪些比较(如果有的话)被标记为 "发现",并能控制错误发现率小于您指定的 Q 值。
1.Benjamini、Krieger 和 Yekutieli 的两阶段递升法(推荐使用)
2.Benjamini 和 Hochberg 的原始 FDR 方法
3.Benjamini 和 Yekutieli 的修正方法(检验力低)
如果选择此选项,Prism 将只对每个指定的成对比较执行单独的对数rank 检验。不会对任何结果进行校正。选择这种方法意味着更有可能错误地判定比较具有 "统计学显著性"。我们建议不要使用此选项,除非您有非常充分的理由这样做。
本部分允许您指定与您为分析选择的多重比较修正方法相关的选项。如果使用统计检验方法修正多重比较,则可以选择报告每次比较的多重性调整 P 值。此外,您还可以指定用于比较族的族α阈值。如果您选择不使用修正方法,则该 alpha 值将适用于每个单独的比较(每个族由单个比较组成,而不是由所有比较组成的单个族)。
如果选择用错误发现率方法进行修正,则可以指定所需的 Q 值。