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引言

在饱和结合实验中,您需要改变放射性配体的浓度并测量结合情况。目的是确定 Kd(平衡时与一半受体位点结合的配体浓度)和 Bmax(结合位点的最大数量)。

配体不仅与受体位点结合,还与非特异性位点结合。处理非特异性结合有三种方法。

减去非特异性,只分析特异性结合

只分析总结合,从总结合曲线的形状推断非特异性结合的量。当配体与两个位点结合时,这种方法效果不佳

一次性全局分析总结合和非特异性结合。这是最好的方法,详细说明如下。

步骤

创建 XY 数据表。在 X 列输入放射性配体浓度,在 Y 列输入总结合力,在 B 列输入非特异性结合力。

X 使用任何方便的单位,Kd 将以相同的浓度单位报告。总结合力和非特异性结合力使用相同的单位。Bmax 将以相同的单位报告。

从数据表中单击 "分析"(Analyze),选择 "非线性回归"(Nonlinear regression),选择 "饱和结合方程"(Saturation Binding equations)面板,然后选择 "方程:双位点 -- 拟合总结合和非特异性结合"(Two sites - Total and nonspecific binding)。

背景(Background)参数是在没有添加放射性配体结合时测得的 "结合",因此代表反背景(如果有的话)。可以考虑将其限制为一个恒定的零值。

模型

Specific1=BmaxHi*X/(X+KdHi)

Specific2=BmaxLo*X/(X+KdLo)

非特异性=NS*X + 背景

<A>Y=特异性1 + 特异性2 + 非特异性

<B>Y=非特异性

 

<A> 和 <B> 语法表示第四行只用于数据集 A(总结合),而第五行只用于数据集 B(非特异性)。

参数 NS 和 Background 在两个数据集之间共享。

解读参数

BmaxHi BmaxLo是两个位点的最大特异性结合,单位与 Y 相同。

KdHi KdLo是平衡解离常数,单位与 X 相同。它是在平衡时达到半最大结合所需的放射性配体浓度。

NS是以 Y 单位除以 X 单位的非特异性结合斜率。

背景是指未添加放射性配体时的非特异性结合量。这代表计数器背景。如果计数器自动减去本底信号,则可将本底限制为一个恒定的零值。

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