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引言

别构调节剂可减少放射性配体结合。该模型适合此类实验,即在缺少和存在调节剂的情况下测量整个放射性配体结合曲线。其目标是了解调节剂与其位点结合的亲和力,并确定α的值,α是一个三元复合物常数,用于量化调节剂的结合改变放射性配体对受体位点的亲和力的程度。

循序渐进

创建一张XY数据表。使用任何方便的单位(可能是nM)将标记配体的浓度输入到X中。以任何方便的单位将特异性结合输入Y中。将无调节剂的数据输入A列。将采用调节剂常数浓度收集的数据输入B列。如有数据,请对C列、D列、E列、……(各列具有不同的调节剂浓度)重复上述步骤。将调节剂浓度输入列标题(单位为纳摩尔,因此1nM输入为“1”)。不要忘记输入“0”作为数据集A的列标题

在数据表中,点击“分析”,选择“非线性回归”,选择“饱和结合方程”窗格,然后选择别构调节剂移位。

您无需将任何参数限制为常数值

模型

Hot=X

Alpha=10^logalpha

KB=10^logKB

KApp=KDHot*((1+Allo/KB)/(1+alpha*Allo/KB))

Y=Bmax* Hot /(Hot+KApp)

解读参数

Kb 是与其变构位点结合的调节剂平衡解离常数(摩尔)。该对数采用相同的摩尔单位,用于将调节剂浓度输入数据表的列标题。

KdHot是放射性配体的平衡解离常数。单位与所输入X值的相同,在本示例中为nM。

α 三元复合物常数。α=1.0时,调节剂不会改变结合。如果α小于1.0,调节剂会减弱配体结合。如果α大于1.0,调节剂会增强结合。在所示的示例中,α等于0.01,因此调节剂大大降低了结合。

注释

该模型设计用于分析未标记化合物通过变构位点起作用时的数据。由于标记和未标记的配体通过不同的位点起作用,将调节剂称为竞争剂是不合适的(也是不正确的)。

该模型是为拟合α的对数(而非α本身)而创建。这是因为α不对称(从0到1的所有值均意味着调节剂减弱结合,而从1到无穷大的所有值均意味着调节剂增强结合。在对数标度上,其值更加对称,因此在对数标度上计算的置信区间(如Prism所计算)更精确。Prism报告α和log(α)。

该模型假设变构调节剂过量,因此您添加的浓度非常接近其自由浓度。当变构调节剂的浓度有限时(如G蛋白改变与许多受体结合的激动剂时),该模型不起作用。没有明确的模型可以处理这种情况。您需要使用隐式方程(等号两边均为Y)来定义该模型,而Prism不能处理此类方程。

参考文献                                                                         

A. Christopoulos和T. Kenakin,Pharmacol,版本54:323-374,2002

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