在饱和结合实验中,改变放射性配体的浓度,并测量结合度。目标是确定两种受体的Kd(平衡时结合一半受体位点的配体浓度)和Bmax(最大结合位点数)。
配体不仅结合受体位点,还结合非特异性位点。处理非特异性结合有三种方法。
•减去非特异性结合,且仅分析特异性结合。请继续阅读这种方法。
•仅分析总结合,根据总结合曲线的形状,推断非特异性结合的量。有两类受体时,这种方法效果不佳。
•同时全局分析总结合和非特异性结合。了解更多。
创建一张XY数据表。将放射性配体浓度输入X,将特异性结合速度输入Y。如果您有若干个实验条件,则将第一个输入A列,第二个放入B列,依此类推。
另一种替代方法是,将总结合输入到A列,将非特异性结合输入到B列。然后,使用“删除基线”分析,从A列中减去B列,以创建包含特异性结合的新结果表。
从特异性结合表中,单击分析,选择非线性回归,选择饱和结合方程窗格,然后选择双位点 - 特异性结合。
位点1=BmaxHi*X/(KdHi+X)
位点2=BmaxLo*X/(KdLo+X)
Y=Site1 + Site2
BmaxHi 和 BmaxLo 是以与Y相同单位对两个位点的最大特异性结合。
KdHi 和 KdLo 是平衡解离常数,以与X相同的单位。这是处于平衡状态时,达到一半最大结合所需的放射性配体浓度。
下图左侧显示了放射性配体与两个独立结合位点的结合,两者浓度相等,但Kd相差10倍。两条单独的曲线显示为虚点曲线和虚曲线。进行实验时,您无法观察单个分量,但可观察显示为一条实曲线的总和。请注意,这条曲线并非明显的双相曲线。
右侧窗格显示了在斯卡查德图上绘制的相同数据。与每个受体的结合数显示为直线(点线或虚线)。绘制在斯卡查德图上的总结合呈曲线。注意,代表与每种受体结合的两条线非曲线的渐近线。
如需绘制对应于非线性回归拟合的两条直线,请使用非线性回归确定的Bmax和Kd值创建一个新的数据表,定义如下所示的两条直线。
X |
. |
B |
0 |
Bmax1/Kd1 |
|
Bmax1 |
0 |
|
0 |
|
Bmax2/Kd2 |
Bmax2 |
0 |
|
转至斯卡查德转换数据的图表,将新表拖动到该图表。使用“设置图表格式”对话框,使用连接线而非符号绘制表格中的两个数据集。