通过测量放射性配体结合的竞争,可确定未标记配体的平衡解离常数。
创建一张XY数据表。将未标记化合物的浓度的对数输入到X中,并结合到Y中。如果有几个实验条件,将第一个放入A列,第二个放入B列,依此类推。使用子列输入重复项。
在数据表中,点击“分析”,选择“非线性回归”,选择“竞争结合方程”窗格,然后选择单位点-拟合Ki
根据实验设计,您必须将两项参数限制为常数值:
•RadioligandNM是标记配体的浓度,单位为nM。整个实验使用单一浓度的放射性配体。
•HotKdNM是标记配体的平衡解离常数,单位为nM。
logEC50=log(10^logKi*(1+RadioligandNM/HotKdNM))
Y=底部+(顶部-底部)/(1+10^(X-LogEC50))
顶部 和底部均为以Y轴为单位的稳定段。
logKI 是未标记配体的摩尔平衡解离常数的对数。
Ki是平衡解离常数,单位为摩尔。
该模型直接拟合未标记配体的Ki。它不报告EC50,因此无需应用Cheng和 Prusoff 修正(1)。取而代之的是,您输入放射性配体的浓度及其常数 Kd,Prism将直接拟合冷化合物的Ki。如果您想了解IC50,则拟合log(剂量)反应曲线。
如果您想了解IC50(在此情况下,IC50的信息不太丰富),则通过替代方程拟合数据。
分析假设您有一个位点,该结合可逆且处于平衡状态。
1.Cheng, Y.和Prusoff, W. H.。抑制常数(K1)与对酶促反应产生50%抑制(I50)的抑制剂浓度之间的关系。《生化药理学杂志》,22: 3099-3108,1973。