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引言

同源 结合实验是一种标记和未标记的配体对受体具有相同亲和力的实验。一般来说,这是因为两者在化学上相同。通过分析不同浓度的未标记配体与一种(或两种更好)浓度的标记配体的竞争来确定受体数量和亲和力。

循序渐进

创建一张XY数据表。将未标记化合物浓度的对数输入X中,并结合到Y中。输入标记配体的浓度(nM)作为列标题。如果使用两种不同浓度的标记配体,会得到更好的结果。

如果有几个实验条件,将第一个放入A列,第二个放入B列,依此类推。使用子列输入副本。

在数据表中,点击“分析”,选择“非线性回归”,选择“竞争结合方程”窗格,然后选择单位点 - 同源。

模型

coldnm=10^(x+9);冷浓度(nM)

kdnm=10^(logkd+9);Kd(nM)

Y=(Bmax*HotNM)/(HotNM+ColdNM+KDnm)+Bottom

 

解读参数

logKd平衡解离常数的对数。由于分析是基于标记和未标记配体以相同亲和力结合的假设,logKd适用于两种形式的配体。

Bmax 是c中配体与受体的最大结合pm.代表与所有受体的结合,因此高于曲线顶部稳定段。

NS是非特异性结合的测量,是以Y轴为单位的底部稳定段除以热配体浓度(nM)。换言之,是非特异性结合热配体的一部分。

Prism对曲线进行全局拟合,从所有数据集中找到一个logKd、Bmax和NS的共享值

注释

该模型假设热配体和冷配体与受体同样地结合,且使用两种浓度的热配体(在A列和B列中..)和各种冷配体,其假设添加一小部分的配体结合,因此自由浓度很接近所添加的。

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