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引言

同源 结合实验是指标记配体和未标记配体对受体的亲和力相同。一般来说,这是因为两者的化学性质相同。受体数量和亲和力是通过分析不同浓度的未标记配体对一种(或两种)浓度的标记配体的竞争来确定的。

步骤

创建 XY 数据表。在 X 列输入未标记化合物浓度的对数,在 Y 列输入结合浓度。如果使用两种不同浓度的标记配体,结果会更好。

如果有几种实验条件,可将第一种放入 A 栏,第二种放入 B 栏,等等。使用子列输入重复数据。

在数据表中单击 "分析"(Analyze),选择非线性回归(Nonlinear regression),选择 "竞争性结合方程"(Competition Binding equations)面板,然后选择 "单位点-同源"(One site - Homologous)。

模型

ColdNM=10^(x+9) ;冷浓度,单位 nM

KdNM=10^(logKD+9) ;Kd 单位为 nM

Y=(Bmax*HotnM)/(HotnM + ColdNM + KdNM) + Bottom

 

解读参数

logKd平衡解离常数的对数。由于分析基于已标记和未标记配体以相同亲和力结合的假设,因此 logKd 适用于两种形式的配体。

Bmax 是配体与受体结合的最大值,单位为 cpm。这代表与所有受体的结合,因此高于曲线的顶峰。

NS是衡量非特异性结合的指标。它是以 Y 轴为单位的底部高原除以以 nM 为单位的热配体浓度。换句话说,它是热配体非特异性结合的比例。

Prism 对曲线进行全局拟合,以便从所有数据集中找到一个共同的 logKd、Bmax 和 NS 值。

注释

该模型假定热配体和冷配体与受体的结合完全相同,并且使用两种浓度的热配体(A 列和 B 列......)并改变冷配体的浓度。它假定加入的配体只有一小部分与受体结合,因此游离浓度与加入的浓度接近。

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