当X值是剂量或浓度的对数时,使用该方程。当X值是浓度或剂量时,使用相关方程。
当竞争性抑制剂存在于结合实验中时,其与激动剂竞争以结合受体,且其会使剂量-反应曲线右移,而不改变最大反应(在足够高浓度的激动剂下,可以克服竞争性抑制剂的影响,并且仍可获得最大反应)。该偏移由SchildSlope量化。在真正的竞争性抑制条件下,SchildSlope值将等于1.0。该模型将SchildSlope的值约束为1.0。此外,Prism还提供有相关方程,其中,SchildSlope不受约束。本分析通过全局拟合多条曲线进行,其中一条曲线拟合无抑制剂时的值,而其他曲线则拟合具有不同浓度的竞争性抑制剂时的值。通过对这些曲线进行全局拟合,可确定竞争抑制剂的亲和力。
1.创建一张带子列的XY数据表,以匹配您的实验设计。
2.在X中输入激动剂配体的浓度对数。例如,如果浓度为1nM,则输入-9。请勿输入“1e-9”。
3.采用任何实用单位,将反应输入Y。将无抑制剂的数据输入A列。将采用抑制剂常数浓度收集的数据输入B列。如有数据,请对C列、D列、E列、……(各列具有不同的抑制剂浓度)重复上述步骤。
4.以摩尔为单位输入抑制剂浓度,作为数据表的列标题。如果浓度为1nM,在列标题中输入“1e-9”或“0.00000001”。不要输入“-9”。由于这些数据是无抑制剂的对照数据,因此不要忘记输入“0”作为数据集A的列标题。输入到列标题中的这些值用于分析;其不仅仅是标签,因此需要以正确的格式输入。
5.在数据表中,点击“分析”,选择“非线性回归”,然后选择“方程:剂量反应-特异性,X为log(浓度)”窗格。然后选择Gaddum/Schild EC50偏移(SchildSlope=1),X为log(浓度)。
6.考虑将HillSlope参数约束为其标准值1.0(SchildSlope已约束为1.0)。如果没有很多数据点,因此无法拟合这些参数时,这尤其有用。
•书写该方程时,输入X值作为激动剂的浓度对数,将列标题作为拮抗剂的浓度。这就是该方程的简单写法。如果愿意,可轻松复制该方程并用不同惯例进行改写。此外,Prism还提供有相关方程,其中,X值输入为激动剂浓度。
•EC50以您输入X值的相同单位的反对数报告。如果输入的X作为log(摩尔),则EC50的单位就是摩尔。如果输入的X值作为log(以毫克为单位的剂量),则EC50将以毫克为单位。
•pA2是拮抗剂浓度的负对数,需将曲线移动2倍。该浓度与您在列标题中输入拮抗剂浓度时使用的单位相同。如果在列标题中输入浓度的单位为nM,则pA2是nM的负对数。如果以mg/kg为单位输入浓度,则pA2就是mg/kg的负对数。
•如果想将pA2转换成浓度,首先翻转符号(乘以-1),然后取反对数(十的幂)。如果也这样处理置信限,注意翻转符号也会改变限的顺序,因此“下”置信限实际上是上限,而“上”限实际上是下限。Prism将该值报告为A2。
EC50=10^LogEC50
Antag=1+(B/(10^(-1*pA2)))
LogEC=log(EC50*Antag)
Y=Bottom+(Top-Bottom)/(1+10^((LogEC-X)*HillSlope))
EC50和LogEC50:EC50是在无抑制剂的情况下引起一半最大反应的激动剂浓度。logEC50采用与您输入X值相同的单位。EC50采用这些单位的反对数。
pA2是指拮抗剂浓度的负对数,需将剂量反应曲线移动2倍。由于SchildSlope固定为1.0,则为pKb,即,与受体结合的抑制剂的平衡解离常数(摩尔)的负对数。对于该模型,Prism同时报告pA2和as logKb。单位是您在数据表上输入浓度作为列标题所用任何单位的对数标度。
A2是指将剂量反应曲线移动2倍所需的拮抗剂浓度。由于SchildSlope固定为1.0,则为Kb,即,与受体结合的抑制剂的平衡解离常数(摩尔)。对于该模型,Prism报告Kb,否则,Prism报告A2。单位与在数据表中输入浓度作为列标题时使用的单位相同。
HillSlope用于描述曲线族的陡度。HillSlope 1.0为标准值,您应该考虑将斜率限制为常数值1.0。
顶部和底部均为Y轴单位的稳定期。
注:
•所有这六项参数在所有数据集之间共享,因此您将只会看到每项参数的最佳拟合值,而非每个数据集的最佳拟合值。
•Prism未报告每条曲线的EC50,仅报告第一条曲线的EC50(无任何拮抗剂的曲线)。
•模型中的变量B定义为一个数据集常数,其值来自列标题。结果页面将显示这些B值。确保其是每个数据集中使用的拮抗剂浓度(而非浓度的对数)。
•该模型未明确将SchildSlope 作为一项参数。 原因在于其约束为常数值1.0。该值用于量化移动与竞争相互作用预测的一致性。如果竞争者有竞争力,则SchildSlope将等于1.0。应考虑将SchildSlope约束为常数值1.0。如果SchildSlope不受约束,则拮抗剂项包含一个S次幂表达式,其中S表示SchildSlop因子。如果向右移动大于竞争相互作用的预测,则S将大于1。如果向右移动小于竞争相互作用的预测,则S将小于1。
Colquhoun(1)研究显示,只要您能做出这些假设,Schild模型就有效:
•拮抗剂B是一种真正的拮抗剂,单独使用不会改变受体的构象。
•激动剂A和拮抗剂B的结合在每个结合位点均互斥。
•B对每个结合位点均有相同的亲和力。
•如果A占用的每个位点相同,则不论有多少位点被B占用,观察到的反应相同。
•在平衡状态下进行测量。
1.Colquhoun,D.,为什么Schild方法比Schild意识到的要好。《药物学研究进展》(2007)第28卷(12)第608-14页