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什么是列常数?

同时拟合多个数据集时,可使用列标题作为第二个独立变量。我们将该约束参数称为“列常数”。最好通过示例加以验证。

如何输入列常数

如需了解列常数如何工作,请使用示例数据文件创建一个新的XY表:酶动力学 - 竞争性抑制。

数据表有一个X列和四个Y列,每个列表示不同抑制剂浓度。抑制剂浓度作为列标题输入。

请注意,Prism仅读取列标题中的数字。在该示例中,单位指定为微摩尔,但Prism忽略了这一点,仅读取数字,不进行任何单位转换。

拟合数据时指定列常数

选择初始值时,从下拉列表中选择“列标题值的平均值”或“对数(列标题值的平均值)”。

示例

如需拟合上述样本数据,请点击分析,选择非线性回归,选择方程的酶动力学窗格,然后选择竞争性酶动力学。该方程是是内置的,但如果点击“详情”按钮,则可看到数学公式。

KmObs=Km(1+[I]/Ki)

Y=Vmax*X/(KmObs+X)

第一行定义了一个中间变量(KmObs,竞争性抑制剂存在时观察到的米氏常数),其为酶的米氏常数(Km)、抑制剂浓度(I)和竞争性抑制常数(Ki)的函数。

第二行计算酶反应速度(Y)作为底物浓度(X)和KMapp的函数。

定义该模型时,I被约束为一个数据集常数,这意味着其值来自列标题。因此,在该示例中,拟合A列时,I=0,拟合B列时,I=5,依此类推。Πρισμ⎬_ευΝ标题中的“mM”-它不进行任何单位转换。

其他三项参数(Km、Ki和Vmax)定义为共享,因此 Prism拟合一个适用于整个数据集族的最佳拟合值。

Prism测定不含抑制剂的酶的最大反应速度(Vmax,单位与您输入的Y值相同)、不含抑制剂的酶的米氏常数(Km,单位与X值的单位相同)和竞争性抑制常数(Ki,单位与列常数的单位相同)。请注意,I不是需拟合的参数,而是采用您在列标题中输入的常数值。KmObs不是要拟合的参数,而是用于定义模型的中间变量。

了解有关酶竞争性抑制的更多信息。

总结。列常数的优势

通过使用列常数和全局拟合(共享参数),本示例确定了参数(Ki),该参数的值不能根据任何一个数据集确定,而只能通过检查数据集之间的关系来确定。

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