通过测量放射性配体结合的竞争,可确定未标记配体的平衡解离常数。
创建一张XY数据表。将未标记化合物的摩尔浓度的对数输入到X中,并结合到Y中。如果有几个实验条件,将第一个放入A列,第二个放入B列,依此类推。使用子列输入重复项。
在数据表中,点击“分析”,选择“非线性回归”,选择“竞争结合方程”窗格,然后选择双位点 - 拟合Ki。
根据您的实验设计,您必须将三项参数限制为常数值:
•HotNM是标记配体浓度(nM)。整个实验使用单一浓度的放射性配体。
•HotKdNMHi 是高亲和力位点标记配体的平衡解离常数(nM)。
•HotKdNMLo 是低亲和力位点标记配体的平衡解离常数(nM)。
logEC50Lo=log(10^logKiLo*(1+HotNM/HotKdNMLo))
logEC50Hi=log(10^logKiHi*(1+HotNM/HotKdNMHi))
Span=Top - Bottom
Part1=FractionHi*Span/(1+10^(X-LogEC50Hi) )
Part2=(1-FractionHi)*Span/(1+10^(X-LogEC50Lo) )
Y=Bottom+Part1+Part2
顶部 和底部均为以Y轴为单位的稳定段。
FractionHi是对竞争配体具有高亲和力的所有位点的分数。
logKi_Hi和logKi_Lo是两个摩尔Ki值的对数。
该模型直接拟合未标记配体的两个log(Ki)值。它不报告IC50,因此无需应用Cheng和 Prusoff 修正(1)。取而代之的是,您输入放射性配体的浓度及其常数 Kd,Prism将直接拟合冷化合物的Ki。如需拟合两个IC50值而非Ki值,请使用不同方程。
分析假设已知两个位点对标记配体的亲和力。在许多情况下,放射性配体对两个位点具有相同亲和力。在此情况下,仅需输入该值两次。如果两个位点对标记配体具有不同亲和力,则输入两个值(由其他实验确定)。注意标签。常数KdHi是对未标记配体具有高亲和力的受体的热配体的Kd,KdLo是对未标记配体具有低亲和力的受体的热配体的Kd,因此KdHi可能比KdLo大或小。
该分析假设结合可逆且处于平衡状态。其还假设标记和未标记配体竞争相同结合位点。
1.Cheng, Y.和Prusoff, W. H.。抑制常数(K1)与对酶促反应产生50%抑制(I50)的抑制剂浓度之间的关系。《生化药理学》,22: 3099-3108,1973。