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X值是剂量或浓度的对数时,使用该方程。X值是浓度或剂量时,使用相关方程

引言

许多log(抑制剂)与反应曲线的关系遵循常见对称的西格摩德形状。

如果拥有良好的控制数据,则 将反应标准化 为运行介于0%与100%之间具有意义。该模型假设数据已标准化,因此强制曲线从100%的游程下降到0%,旨在确定抑制剂的IC50-引起反应的浓度等于50%。

仅当确定已非常准确定义0%和100%时,拟合一个标准化模型才有意义。如果数据定义了一条完整的西格摩德曲线,最好是拟合整条曲线,并让Prism拟合顶部和底部稳定段。如果数据没有形成完整的西格摩德曲线,但可通过实体控制数据定义底部和顶部,则拟合到标准化模型是更好的选择。

许多抑制剂量反应曲线的标准斜率为-1.0。该模型并不假设标准斜率,而是根据数据拟合Hill斜率,因此称为 “可变斜率 模型”。有大量数据点时,这是更好的选择。

循序渐进

创建一张XY数据表。将抑制剂浓度的对数输入X。采用任何简便单位将反应输入Y。在A列中输入一个数据集,并根据需要将B、C...列用于不同的治疗方法。

如果偏向输入浓度,而非浓度的对数,请使用Prism将X值转换为对数

从数据表中,点击分析,选择非线性回归,选择方程组“剂量反应曲线-抑制”,然后选择方程“log[抑制剂] vs. 标准化反应--可变斜率

模型

Y=100/(1+10^((LogIC50-X)*Hill斜率)))

 

解读参数

IC50是激动剂浓度,可在底部和顶部之间产生一半反应。与Y=50时的反应不同,取决于用什么单位表示Y,以及底部和顶部的值,IC50可能给出一个不接近“50”的反应。Prism会报告IC50及其对数。

Hill斜率 描述了曲线族的陡度。Hill斜率-1.0是标准值,您应考虑将斜率限制为常数值-1.0。Hill斜率小于-1(比如-2)时更陡。

 

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