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在多变量图形的数据对象中,树枝图是独一无二的,因为它只能作为分层聚类分析结果的一部分来创建。此外,树枝图可以作为单独的独立图形,也可以作为添加到热度图(由分层聚类分析创建)中的对象。通过格式图表对话框的 "树枝图选项"页面,您可以在这些图表中添加和自定义这些数据对象,其内容和布局将依赖于树枝图是独立图表还是作为热度图的附加内容。
所需数据结构
生成树枝图(无论是作为独立图形还是作为热度图的装饰)的唯一方法是将其作为分层聚类分析输出的一部分。您的数据不需要特异性数据结构,因为Prism 会根据要求自动生成这些图形,作为分层聚类分析输出的一部分。
格式选项(独立树枝图)
通过选项页面顶部的复选框,您可以打开或关闭图形上的树枝图。在 macOS 上,这是一个切换框,而不是复选框。
分支
树枝图选项页面的这个选项卡允许你自定义树枝图分支(线条)的视觉外观。如果您在进行分层聚类分析时没有指定聚类数目(或切割高度),则只能使用 "单色"外观选项。但是,如果您选择在分析参数对话框中指定簇数(或切割高度),则还可以选择外观选项 "变异性(按簇)",这样就可以为生成的树枝图中的每个簇指定不同的视觉属性。这些属性包括
•配色方案/颜色--选择一个内置配色方案,根据聚类分配分支的颜色,或选择一个 特异性分组并分配自定义颜色
•透明度--设置树枝图分支的透明度级别
•厚度 - 定义树枝图分支的线重
•样式 - 定义树枝图分支使用的线型
•方向 - 指定树枝图是具有垂直距离轴和水平标签轴("垂直"),还是具有水平距 离轴和垂直标签轴("水平")。
标签
通过这些选项,您可以指定树枝图标签轴上的标签外观。标签类型允许您在变异性(默认)、字母(A、B、C......)或数字(1、2、3......)之间进行选择。"起始标签"选项表示最先显示哪个标签(在此标签之前的所有标签都将从图表中省略),而 "间隔"选项表示显示标签的频率。本示例假设使用数字作为标签。如果起始点选项设置为 4,间隔选项设置为 3,那么
•标签 1、2 和 3 将不会显示
•标签 4 将是第一个显示的标签
•不显示标签 5 和 6
•将显示标签 7,不显示标签 8 和 9
•显示标签 10,不显示标签 11 和 12...
在此选项卡中,您还可以定义树枝图标签的字体和旋转角度。
距离轴
距离轴有时也称为 "高度 "轴,用于显示在分层聚类过程中形成的聚类之间的距离。通过这些控件可以指定距离轴的可视化属性,包括
•坐标轴的颜色
•坐标轴的透明度值
•坐标轴的粗细
•坐标轴的线条样式(图案
请注意,目前无法调整距离轴的显示范围、刻度线间隔或其他属性。
格式选项(作为热度图一部分的树枝图)
通过选项页面顶部的复选框,可以打开或关闭图形上的树枝图。在 macOS 上,这是一个切换选项,而不是复选框。请注意,切换该选项将启用或禁用图形上的所有树枝图。作为分层聚类分析的一部分,您可以选择在行、列或两者上执行聚类(从而生成树枝图)。如果出于某种原因,您选择在行和列上都执行聚类,但希望在相关热度图上只显示其中一个或另一个树枝图,请不要使用此主切换项。相反,请将相应的下拉菜单(纵轴或横轴)设置为 "无"(详情见下文)。
添加到热度图的每个树枝图都由其绘制的坐标轴定义:"垂直轴"或 "水平轴"。这是因为热度图本身可以将数据的行映射到横轴或纵轴上,数据的列也是如此。因此,如果数据行被分配到热度图的横轴上,那么分配到横轴上的树枝图将与对数据行执行的聚类结果相对应。如果在分层聚类分析中未对行或列进行聚类,则相应的树枝图选项将被禁用。
对于进行了分层聚类的每个轴,您都可以选择指定该轴的树枝图的一般外观:
•无--禁用(或隐藏)该树枝图。请注意,这是仅禁用一个树枝图而保留另一个树枝图的方法。
•单一颜色--这将允许您为树枝图的所有分支指定单一选项集(颜色、透明度、粗细、样式)。
•变异性(按聚类)--该选项允许您为该树枝图的分层聚类分析所定义的每个聚类单 独指定选项(颜色、透明度、粗细、样式