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什么是火山图?

运行多个t检验时,Prism(自版本8开始)会自动创建称之为 火山图

每个点代表数据表中的一行。

X轴绘制平均值之间的差值。在X = 0处显示一条点网格线,没有差值。

在Y轴上绘制的值取决于您的选择。

如果选择统计学显著性方法,但未对多重比较进行校正,则火山图中的Y值是P值对数的负一倍。因此,如果P值是0.01,则对数(以10为底数)是 - 2,且在Y轴上绘制的值是2.0。

如果选择带有多重比较校正的统计学显著性方法,则Y轴是多重性调整后P值的负对数。

如果选择的是FDR方法,则Y值将绘制q比值的负对数。

 

注意

所有对数均以10为底数。

如果使用统计学显著性方法,则Prism会在X = 0(无差值)和Y = - log(alpha)处自动绘制一条网格线,如果选择FDR方法,则在 - log(Q)处自动绘制一条网格线。

自动创建火山图,Prism不能选择不创建该图。但很容易删除。

您经常会看到这种火山图,其中X是两个平均值的比值。但t检验关注的是差值,而非比值。如果您关心比值,考虑将所有值转换配对数,然后运行多重t检验分析。这利用两个对数之间的差值等于其比值的对数这一事实。

.关于火山图的Wikipedia文章会提供提供信息。

 

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