可将方程分成多行书写。举个示例，内置于Prism的混合模型酶抑制模型：

VmaxApp=Vmax/（1+1/（Alpha*Ki））

KmApp=Km*（1+I/Ki）/（1+I/（Alpha*Ki））

Y=VmaxApp*X/（KmApp+X）

Prism遵循所有计算机语言的约定。其从顶部开始且向下。

首先，其计算中间变量VmaxApp。其知道这是一个中间变量，而非一个可拟合参数，因为该参数出现在等号左边。

接下来，Prism将计算KmApp的值。

最后，其使用这两个值来计算Y。

数学书倾向于以相反的顺序书写方程。数学文本可能首先将Y定义为VmaxApp和KmApp的函数，然后在页面下方定义如何通过Vmax、Km、Alpha和I计算VmaxApp和KmApp。Prism（与所有的计算机语言相似）要求您在使用之前定义一个中间变量。

此处为第二个示例：

特异性=X*Bmax/（X+Kd）

非特异性=NS*X

<A>Y=特异性+非特异性

<B>Y=非特异性

 

第一行计算中间变量 特异性。第二行定义中间变量非特异性。

第三行行首是＜A＞。这意味着该行仅适用于数据集A。第二行行首是＜B＞，因此其仅适用于数据集B。这允许模型拟合数据表，其中A列是总结合，B列是非特异性结合。阅读有关“用于指定特定行仅适用于选定数据集的语法”的更多信息。

您可在多行方程中正确定义常数。这对于定义真常数来说是有意义的，这些值永远不会改变。如果常数类似于随着实验的不同而改变的浓度，则最好避免在方程本身中对其进行定义，而是在其中进行定义“约束”选项卡。如其首先出现在方程右侧，则Prism会将其视为一项参数。您可使用“限制”选项卡将该参数固定为常数值。如果变量名首先出现在等号左侧，则其仅在方程中使用，而不会出现在限制选项卡中。例如，该行定义Pi：

Pi=3.141529