酶动力学的标准分析（本文讨论唯一一种）假设：

•在所用时间间隔内，产物的产量与时间呈线性关系。

•底物浓度远远超过酶浓度。这意味着底物的游离浓度非常接近于添加的浓度，且在整个检测过程中底物浓度基本上恒定。

•单一酶形成这种产物。

•无酶的产物可以忽略不计。

除内置别构模型外，Prism的内置方程还假设：

•无协同性。底物与一个酶结合位点的结合不影响相邻位点的亲和力或活性。

•底物和产物均不能作为别构调节剂来改变酶速度。